無料モジュール
バイオインフォマティクス入門:配列とアラインメント
バイオインフォマティクスを Python で手を動かして学びます。DNA配列、FASTA、アラインメントのスコア、モチーフ、コドンの翻訳を扱います。
6件のレッスン340分のレッスンAI とデータサイエンス
レッスン一覧
どのレッスンも全文を無料で読めます。無料アカウントを作ると、コマンドをラボで実行し、クイズと課題に取り組めます。
1 · コンテナラボ
DNA配列を文字列で数える
DNA配列の塩基を数え、GC含量と逆相補鎖を求められる。
レッスンを読む2 · コンテナラボ
FASTAファイルの読み方
FASTA形式の文字列から、配列の名前と配列を取り出せる。
レッスンを読む3 · コンテナラボ
ペアワイズアラインメントとは
2本の配列の並べ方に、一致、不一致、ギャップの点をつけて、スコアを求められる。
レッスンを読む4 · コンテナラボ
スコアとギャップペナルティ
点のつけ方を変えて、よい並べ方が変わることを確かめられる。
レッスンを読む5 · コンテナラボ
配列からモチーフを見つける
配列から k-mer を取り出して数え、モチーフの出現位置を探せる。
レッスンを読む6 · コンテナラボ
コドンからタンパク質への翻訳
コドン表を使って、DNA配列を3文字ずつ読み、タンパク質の配列に翻訳できる。
レッスンを読む
本物のラボで実習
このモジュールのレッスンは、あなた専用に起動するラボで実習します。使うラボ:
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