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Module gratuit

Bio-informatique : séquences et alignement

Apprenez la bio-informatique en Python : séquences d’ADN, fichier FASTA, alignement et score, motifs et k-mers, codons.

6 leçonsLeçon de 365 minIA et science des données

Les leçons

Chaque leçon se lit gratuitement en entier. Créez un compte gratuit pour lancer ses commandes dans un laboratoire et passer ses quiz et ses exercices.

  1. 1 · Labo de conteneurs

    Compter les bases d’une séquence d’ADN

    Je peux compter les bases d’une séquence et calculer son complément inverse.

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  2. 2 · Labo de conteneurs

    Lire un fichier FASTA

    Je peux lire un fichier FASTA et en tirer le nom et la séquence de chaque enregistrement.

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  3. 3 · Labo de conteneurs

    Alignement de deux séquences

    Je peux calculer le score d’un alignement de deux séquences avec un tableau.

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  4. 4 · Labo de conteneurs

    Changer le score et le prix d’un trou

    Je peux changer le score et le prix d’un trou et dire comment l’alignement change.

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  5. 5 · Labo de conteneurs

    Chercher un motif et compter les k-mers

    Je peux compter les k-mers d’une séquence pour trouver le motif le plus fréquent.

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  6. 6 · Labo de conteneurs

    Traduire des codons en protéine

    Je peux traduire une séquence en protéine avec une table de codons et un cadre de lecture.

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Travaillé dans un vrai laboratoire

Chaque leçon de ce module se travaille dans un laboratoire lancé pour vous seul. Les laboratoires utilisés :

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